灵芝有十分良好的抗细胞突变、降低肿瘤发生率的作用。中国疾病预防控制中心崔文明、刘泽钦等试验发现，灵芝有抑制细胞突变药物环磷酰胺诱发小鼠骨髓细胞为微核千分率的升高，细胞微核千分率的增加，就标志着细胞突变率的增加。灵芝还能降低丝裂霉素诱导的中国仓鼠V₇₉细胞（用于肿瘤试验用的特地昂鼠种和细胞株，特定种鼠、特定细胞有利于试验结果的观察和正确性）基因突变的发生率。

健康小鼠30只，体重26~28克，分成三组，每组10只，两组口服灵芝水提取物，每20克体重的鼠每天分别灌服0.2、0.4克的灵芝水提取物，连续30天，对照鼠口服蒸馏水，至灌服灵芝水提取物最后两天时，小鼠每千克体重注射致细胞突变药物环磷酰胺，每千克体重注射40mg，共2次，两次之间间隔24小时，第2次注射环磷酰胺6小时后处死小鼠，检查胸骨骨髓细胞微核数。结果：不服灵芝的小鼠 微核千分率为29.3，每千克体重服0.2和0.4克灵芝提取液鼠，微核千分率为23.1和16.8.服灵芝提取液鼠，微核千分率明显低于对照小鼠的微核提取液小鼠的微核千分率明显低于对照小鼠的微核千分率，并显示灵芝提取液服量多，微核千分率降低更显著。

健康小鼠40只，每只小鼠体重26~30克，分成4组，每组10只，试验组鼠灌服灵芝提取液，剂量分别为3.3ml/kg、10ml/kg和30ml/kg，对照鼠口服蒸馏水。口服灵芝提取物液和蒸馏水至第7天时，4组小鼠均口服致突变药物丝裂霉素，每千克体重口服2mg，然后再分别继续口服灵芝提取液和蒸馏水，连续13天，处死小鼠前6小时，在腹腔注射致细胞突变药物秋水仙素，每千克体重注射4毫克，动物处死后取睾丸、曲精细管，油镜下观察初级精母细胞畸变率。结果：每千克体重注射30ml灵芝提取液的鼠，睾丸细胞染色体畸变率为2%，而不注射灵芝提取液鼠的睾丸畸变率为4%。

杨星昊、方放治等试验，昆明种小鼠50只，分成5组，每组10只，试验鼠每千克体重每日分别灌服200mg/kg、1000mg/kg和5000mg/kg灵芝孢子水溶液，同时腹腔注射液环磷酰胺，每天100mg/kg，连续8天，阴性对照组单注射等量生理盐水，阳性对照组单注射环磷酰胺药物，也连续8天停药后处死动物，取胸骨骨髓制成细胞悬液，显微观察，计算微核千分率。结果：没注射环磷酰胺鼠的微核千分率为1.6，单注射环磷酰胺鼠微核千分率为30.4，注射环磷酰胺又注射灵芝提取液的鼠，微核千分率为30.9、25.8和13.7.试验表明：灵芝孢子粉有明显保护细胞，降低致突变药物引起的微核千分率的升高。灵芝孢子粉抑制微核千分率的升高呈明显量效关系，灵芝孢子粉用量越多，微核千分率下降越显著。